<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <br>
    More:<br>
    <br>
    In our development environment, I configured full error logging.  I
    then ran one of our queries that is failing, stopped ASpace, then
    began scrutiny of archivesspace.out.<br>
    <br>
    Here are my disturbing findings:<br>
    <br>
    <blockquote>
      <blockquote>E, [2021-03-03T09:47:29.950934 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_associative'
        doesn't exist: DESCRIBE `agent_relationship_associative`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:29.960346 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_associative'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_associative`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:29.968749 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_associative'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_associative`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:29.984480 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_earlierlater'
        doesn't exist: DESCRIBE `agent_relationship_earlierlater`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:29.987451 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_earlierlater'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_earlierlater`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:29.990034 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_earlierlater'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_earlierlater`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.000084 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_parentchild'
        doesn't exist: DESCRIBE `agent_relationship_parentchild`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.007362 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_parentchild'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_parentchild`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.011525 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_parentchild'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_parentchild`
        LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.021769 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table
        'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_subordinatesuperior'
        doesn't exist: DESCRIBE `agent_relationship_subordinatesuperior`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.024655 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table
        'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_subordinatesuperior'
        doesn't exist: SELECT * FROM
        `agent_relationship_subordinatesuperior` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.028291 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table
        'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_subordinatesuperior'
        doesn't exist: SELECT * FROM
        `agent_relationship_subordinatesuperior` LIMIT 1<br>
        <br>
        <br>
        <br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.166299 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.container_location' doesn't
        exist: DESCRIBE `container_location`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.179378 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.container_location' doesn't
        exist: SELECT * FROM `container_location` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.181948 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.container_location' doesn't
        exist: SELECT * FROM `container_location` LIMIT 1<br>
        <br>
        <br>
        <br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.575599 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_bibliography' doesn't
        exist: DESCRIBE `note_bibliography`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.579327 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_bibliography' doesn't
        exist: SELECT * FROM `note_bibliography` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.606147 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_bibliography' doesn't
        exist: SELECT * FROM `note_bibliography` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.635130 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_digital_object' doesn't
        exist: DESCRIBE `note_digital_object`<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.638129 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_digital_object' doesn't
        exist: SELECT * FROM `note_digital_object` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.645140 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_digital_object' doesn't
        exist: SELECT * FROM `note_digital_object` LIMIT 1<br>
        E, [2021-03-03T09:47:30.651197 #27625] ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.note_index' doesn't exist:
        DESCRIBE `note_index`E, [2021-03-03T09:47:29.960346 #27625]
        ERROR -- :
        Java::ComMysqlJdbcExceptionsJdbc4::MySQLSyntaxErrorException:
        Table 'archivesspaceDevelopment.agent_relationship_associative'
        doesn't exist: SELECT * FROM `agent_relationship_associative`
        LIMIT 1<br>
      </blockquote>
    </blockquote>
    <br>
    <br>
    I took a look directly in the database and these tables are indeed
    missing.<br>
    <br>
    At this point, I am stumped.  I don't understand why, with these
    tables missing, one of our three Repositories would be working just
    fine -- the other two, not so much.  How could whole tables get
    deleted from our ASpace?  I'm guessing this happened a couple weeks
    ago.<br>
    <br>
    Any advice greatly appreciated,<br>
    <br>
    Mark<br>
    <pre class="moz-signature" cols="72"><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><>
Mark Cyzyk, M.A., M.L.S.
Library Applications Group
The Sheridan Libraries
The Johns Hopkins University
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mcyzyk@jhu.edu">mcyzyk@jhu.edu</a>

Verba volant, scripta manent. 
</pre>
    <div class="moz-cite-prefix">On 3/1/21 5:18 PM, Mark Cyzyk wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
      cite="mid:a1c3531f-269d-5b60-b87b-767e28730517@jhu.edu">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <br>
      Thanks, Rachel!<br>
      <br>
      I've now completely reindexed everything (a "hard reindex") and
      still no joy.  <br>
      <br>
      I am noticing there is no "location.dat" file in our
      /indexer_pui_state/:<br>
      <br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_archival_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_classification.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_classification_term.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_digital_object_component.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_digital_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      3_resource.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_archival_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_classification.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_classification_term.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_digital_object_component.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_digital_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      4_resource.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_archival_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_classification.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_classification_term.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_digital_object_component.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_digital_object.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      5_resource.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      _deletes_deletes.dat<br>
      -rw-r--r--. 1 archivesspace archivesspace   11 Mar  1 17:13
      repositories_repositories.dat<br>
      <br>
      Should there be?<br>
      <br>
      Our two problem repositories here are 4 and 5.  The Staff
      interface reports "0" Resources for both.  Yet when I run the
      Resources List Report I do indeed get back a report with
      Resources.  Puzzling.<br>
      <br>
      It's like something in the backend DB has become disconnected, but
      just for these two repositories.  Not sure how.<br>
      <br>
      If anyone has any suggestions, I would greatly appreciate hearing
      them!<br>
      <br>
      Mark<br>
      <br>
      <pre class="moz-signature" cols="72"><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><>
Mark Cyzyk, M.A., M.L.S.
Library Applications Group
The Sheridan Libraries
The Johns Hopkins University
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mcyzyk@jhu.edu" moz-do-not-send="true">mcyzyk@jhu.edu</a>

Verba volant, scripta manent. 
</pre>
      <div class="moz-cite-prefix">On 2/24/21 11:11 AM, Rachel Aileen
        Searcy wrote:<br>
      </div>
      <blockquote type="cite"
cite="mid:CAGFAsrNkx4tGoKbMWOvxi+OQYY79E-nsHNUZumpEcjHd7X3PCw@mail.gmail.com">
        <meta http-equiv="content-type" content="text/html;
          charset=UTF-8">
        <div dir="ltr">
          <div>Hi Mark</div>
          <div><br>
          </div>
          We ran into a similar issue recently, where newly created
          containers were not being properly associated with the
          resource record, and updates to locations or barcodes were not
          showing up in searches or the Manage Top Containers view. We
          looked at the timestamp files for the indexer, and noticed
          that there was no location.dat file. We performed a <a
href="https://github.com/archivesspace/tech-docs/blob/master/administration/indexes.md"
            moz-do-not-send="true">soft re-index</a>, after which our
          containers, barcodes, and locations resumed behaving as
          expected. We also have recurring monthly system restarts
          (which will now include a soft re-index going forward) built
          into our schedule, which seems to help with maintaining
          overall performance.<br>
          <div><br>
          </div>
          <div>I'm not sure if this is exactly what you're experiencing,
            but I hope it's helpful. Take care,</div>
          <div>Rachel</div>
        </div>
        <br>
        <div class="gmail_quote">
          <div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Feb 22, 2021 at 5:45
            PM Mark Cyzyk <<a href="mailto:mcyzyk@jhu.edu"
              moz-do-not-send="true">mcyzyk@jhu.edu</a>> wrote:<br>
          </div>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px
            0.8ex;border-left:1px solid
            rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><br>
            Dear ASpace list,<br>
            <br>
             From one of our Archivists:<br>
            <br>
            > When I create a new container, either manually or by
            spreadsheet <br>
            > ingest, the container appears properly in the Instance
            field of the <br>
            > record. From the resource, I can open the container
            record and it <br>
            > appears to be associated with the resource correctly.
            However, in the <br>
            > container management module, when I search for all
            containers <br>
            > associated with the collection, the recently created
            container is not <br>
            > listed. If I search for the new container's barcode,
            the container <br>
            > appears in the search results but with no associated
            resource. I can <br>
            > also locate the new containers by searching for
            unassociated containers.<br>
            <br>
            It seems like some linkage is not happening here.<br>
            <br>
            More, this is only happening in his Repository, not our
            other, larger <br>
            Repository.<br>
            <br>
            Has anyone else run into this?<br>
            <br>
            Mark<br>
            <br>
            -- <br>
<><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><><br>
            Mark Cyzyk, M.A., M.L.S.<br>
            Library Applications Group<br>
            The Sheridan Libraries<br>
            The Johns Hopkins University<br>
            <a href="mailto:mcyzyk@jhu.edu" target="_blank"
              moz-do-not-send="true">mcyzyk@jhu.edu</a><br>
            <br>
            Verba volant, scripta manent.<br>
            <br>
            _______________________________________________<br>
            Archivesspace_Users_Group mailing list<br>
            <a
              href="mailto:Archivesspace_Users_Group@lyralists.lyrasis.org"
              target="_blank" moz-do-not-send="true">Archivesspace_Users_Group@lyralists.lyrasis.org</a><br>
            <a
href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lyralists.lyrasis.org_mailman_listinfo_archivesspace-5Fusers-5Fgroup&d=DwICAg&c=slrrB7dE8n7gBJbeO0g-IQ&r=WwSkYr7X9POdZNK4180yTjrK5hSljcuCPIN--y1VRZk&m=SmteiGvtNVMomV11nXFZu2vgQ88h7aapUFt6H55qk9o&s=mbxfqYRQtAZn2xsehm9iyXz5ZA-q1Evo07_25hxNzk0&e="
              rel="noreferrer" target="_blank" moz-do-not-send="true">https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__lyralists.lyrasis.org_mailman_listinfo_archivesspace-5Fusers-5Fgroup&d=DwICAg&c=slrrB7dE8n7gBJbeO0g-IQ&r=WwSkYr7X9POdZNK4180yTjrK5hSljcuCPIN--y1VRZk&m=SmteiGvtNVMomV11nXFZu2vgQ88h7aapUFt6H55qk9o&s=mbxfqYRQtAZn2xsehm9iyXz5ZA-q1Evo07_25hxNzk0&e=</a>
            <br>
          </blockquote>
        </div>
        <br clear="all">
        <div><br>
        </div>
        -- <br>
        <div dir="ltr" class="gmail_signature">
          <div dir="ltr">
            <div>
              <div dir="ltr">
                <div>
                  <div dir="ltr">
                    <div>
                      <div dir="ltr">
                        <div>
                          <div dir="ltr">
                            <div>Rachel Searcy<br>
                              Accessioning Archivist, Archival
                              Collections Management<br>
                              <div><span style="font-size:12.8px">New
                                  York University Libraries</span><br>
                              </div>
                              <div><a value="+12129982631"
                                  moz-do-not-send="true">212.998.2539</a> |
                                <a href="mailto:rachel.searcy@nyu.edu"
                                  target="_blank" moz-do-not-send="true">rachel.searcy@nyu.edu</a>
                                <br>
                              </div>
                            </div>
                            <div>My pronouns are she/her/hers</div>
                          </div>
                        </div>
                      </div>
                    </div>
                  </div>
                </div>
              </div>
            </div>
          </div>
        </div>
      </blockquote>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>